试管移植后第六天雌二醇249会影响着床，如果自己的身体出现了这种情况，还是应该要及时的使用黄体酮来帮助自己的身体出现调节，因为出现了这种情况再进行试管试移植的时候容易导致自己出现失败的情况，同时还会产生流产。所以情况还是比较严重的，应该要及时去医院进行专项检查，以免对于自己的身体产生更大的伤害。

雌二醇低会影响着床，但是影响不是特别大，主要还是要看你的hcg数值，此外你现在这个雌二醇数值也不是特别低，所以我认为你不要过于担心和着急，也许迟迟无法着床是因为别的原因引起，比如子宫里面的坏境不好，胚胎本身的质量不好，或者是身体出现了其它的疾病。建议重新做一些其它相关的检查，找到关键的病因，然后再对症处理。