试管备孕期间查出多囊，是会有影响的。多囊是一种内分泌紊乱性的疾病，最根本所导致的问题就是无排卵，这总对于你要试管备孕取成熟的卵子是非常影响的。我建议你跟你的试管医生商讨一套适合你的方案，可以先把六项激素调节正常，这样取卵的时候肯定质量会更好，多囊一般都是由于肥胖引起的，一定要加强锻炼，才能事半功倍。

多囊并不会影响做试管，很多多囊卵巢患者是会选择做试管来受孕的。多囊卵巢综合症双侧卵巢内大于等于12个卵泡，且没有成熟的卵泡可以排出，从而导致月经不调。但是我觉得你原来的试管方案应该是没有多囊的，所以你需要跟你的医生沟通一下，是不是需要更改方案，先调整体内激素水平，达到平稳以后继续试管。