当然会影响怀孕啊，备孕了两年都没有怀孕，这不就是因为月经不调所带来的主要原因吗，治疗月经不调最好是找中医给你开中药，再配合针灸治疗，让他给你通一下血气。虽然过程比较长，可能需要两三个月服用，严重者也有可能需要服用半年才会有所改善，但终究是有效果的，如果你喝了中药没有用，那最好是去换一个医生，因为每个医生开的方子都是不一样的。

备孕两年药物调理月经没有效果会影响怀孕的，备孕过程相当复杂，没有调理好月经就会导致排卵有问题，白带异常等妇科问题，药物调理月经无效果可能是因为药物的使用，过于混乱或者没有按时按量使用或和其他药物起到冲突作用，导致药物被吞噬了效果。而且你的治疗时间太长了药物使用时间太久，可能会导致不孕，建议去正规医院里做相关检查，确认病情再进行治疗。