上海仁济医院最擅长的是消化内科。仁济医院的消化内科在我国的专科排名是第一名，每年的接诊人次达到35万人次/年、内镜量超过7万人次/年，是当之无愧的重点科室，该科室主要治疗胃肠道疾病，针对胃癌、肝炎、肝硬化、肝癌、急性胰腺炎等病症都有很好的诊疗效果。

上海仁济医院始建于1844年，是上海的第一所西医医院，该院目前由东西南北四个院区和上海市肿瘤研究所组成。仁济医院是一个综合性三级甲等医院，有泌尿学科、生殖医学科等多个重点可以，但是在仁济医院所有的科室之中，消化内科最王牌的科室，也是该院的最擅长的科室：

上海仁济医院消化学科是以上海市消化疾病研究所的临床和基础部分为主体组成。系国家重点学科、国家211工程重点学科、上海市重点学科、卫生部消化内科重点实验室、上海市消化内科临床医学中心和上海市“重中之重”临床医学中心，也在卫生部的评审中以全国第一名的成绩成为国家临床重点专科。

消化内科是仁济医院最好的科室，有消化系统疾病的患者可以选择该院进行治疗，同时上海仁济医院的风湿免疫科也是全国专科第三，是医院的传统优势学科，在国内外均具有严重的影响力，还有变态反应科、麻醉科、核医学科等科室都是仁济的重点科室。