巧囊囊肿微创手术后三个月不来月经可以进行激素治疗，制作人工周期，让月经逐步恢复正常，只要按照医生说的，还是很大可能来月经的。由于你左侧卵巢摘除，对排卵肯定是有一定的影响的。还会导致你的内分泌失调，激素紊乱。我个人建议，你首先要去医院做些关于内分泌的检查，例如黄体酮雌激素，性腺6项，来具体判断是什么问题导致的，从而对症下药。

巧囊囊肿微创手术后三个月不来月经应该是卵巢储备功能不好，以后是会来的。这个手术之后要看卵巢储备的，如果这个功能较好的话，恢复排卵是很快的，月经在一个月也就可以恢复的。如果这个功能不好的话，卵巢恢复的时间就会很慢，来月经的时间也是要到两三个月才会来。可以喝些中药来进行针对性的调理，这样月经很快就会恢复的。