女方输卵通畅的情况下，影响胚胎着床的因素有子宫因素和免疫系统因素，如果还存在男方精子畸形的情况，那么胚胎本身也会影响着床。根据研究表明，导致胚胎无法着床的因素有很多，其中就有胚胎本身质量差这种情况，如果男方精子畸形，很有可能会导致胚胎畸形，这样的胚胎是很难成功着床的。

成功妊娠对于有些人来说是一个艰难而又漫长的过程，它不止是要在前期的备孕中进行身体的调理，还要在怀孕的初期仔细的呵护，并且可能由于各种原因，胚胎的着床也会很困难，就算女方输卵管无异常，但是可能也会有其他不可控的因素导致着床失败，就比如说一下这几种情况：

1. 1. 子宫的因素：子宫发育畸形、子宫内膜过薄、粘连、炎症等问题，造成受精卵不能够正常的着床，或者是输卵管不通，受精卵不能通过输卵管进入子宫内进行着床，容易造成异位妊娠；
2. 2. 免疫系统的因素：女性体内的封闭性抗体为阴性时，免疫系统会吞噬或者攻击胚胎，使胚胎无法顺利到达着床位置，从而影响胚胎着床；
3. 3. 受精卵本身的因素：受精卵中的精子存在染色体畸形，导致胚胎畸形或质量较差，虽然形成受精卵但没有成功的着床，随着月经排出体外，称为生化妊娠。

所以，在女方输卵管通而不畅男方精子畸形率高的情况下，影响胚胎着床的因素有以上几点，但是由于个人体质不同，部分患者还会由于体能激素不足或者是其他原因而导致胚胎着床失败，所以想要找出具体的原因，还是要到医院去经过系统的检查后，由专业的医生来得出结论。

随着社会的发展和时代的进步，人们的生活压力不断加大，社会对男性的要求也在不断的增多，这就导致了现在由于男性原因而导致的不孕不育逐渐增多，就比如说精子畸形，这种情况下往往着床是很困难的，但是我们也可以通过以下几种积极的手段来提高胚胎的着床率：

1. 1. 在同房之后要给予适当的休息，卧床一个小时以上，并且在同房之后一定要加强营养，多吃含有雌性激素的食物，比如多喝豆浆、蜂王浆，多吃黑豆、花生酱、洋葱，都有利于受精卵着床；
2. 2. 在同房之后也建议戒烟、戒酒，减少外界不良环境的刺激，以及避免在受污染的环境下生存，比如有油漆、甲醛的环境下，尽量避免在这种环境下生活以及工作，这样就有利于受精卵顺利的着床。

综上所述，导致胚胎无法着床的原因有很多，如果还存在男方精子畸形的情况，这种情况只会更严峻，但是也不要过于焦虑，只要通过积极的治疗，还是有可能正常怀孕的，如果实在是不能，也可以通过试管移植的方式来达到妊娠的目的，第二代试管移植可以很好的解决由于男子精子原因导致的不孕。