两者主要区别在于孟买血型更加稀有,并且孟买血型人群的红细胞中没有A、B、H抗原,但血清中含有抗A、抗B抗体、抗H抗体,而熊猫血主要是RH阴性血。从改革开放以来在我国发现的孟买血型仅有30例左右,而熊猫血已经超过1000名以上。
在世界稀有血型中孟买血型排名第一,熊猫血型排名第三,并且孟买血型通过一般的血型测定是无法检测出的,只有通过特定的血型测定方法才能发现,例如基因分型技术等。