确证怀孕26天但是查不到孕囊有可能是怀孕时间比较短，也有可能存在生化妊娠。如果没有检查出孕囊，这个应该是怀孕的时间短。大多同房后有28天左右。如果查出怀孕没查到妊娠囊，也可能跟生化妊娠或者是宫外孕有关系。如果不存在不腹痛、流血的情况，最好观察一周到10天的，再到医院做B超应该能够看见妊娠囊。如果还看不到，有可能是发生了宫外孕或者是生化妊娠。

怀孕26天检查不出来孕囊是比较正常的一件事情，因为这个时候孕囊发育不久，体积很小。一般的是在怀孕6周之后检查才能看到明显的孕囊，而孕囊的发育是一个很神奇的过程，这也导致了孕囊在6周之前是查不到的。

孕囊6周之前的发育情况：

1. 1. 4周：胎儿只有0.2cm，受精卵刚完成着床，羊膜腔才形成，体积很小，B超看不清妊娠迹象；
2. 2. 5周：胎儿长到0.4cm，进入了胚胎期，羊膜腔扩大，原始心血管出现，可有搏动。B超可看见小胎囊，占宫腔四分之一不到，或可见胎芽；
3. 3. 6周：胎儿长到0.85cm，胎儿头部、脑泡、额面器官、呼吸、消化、神经等器官分化，B超胎囊清晰可见，并可以见到胎芽及胎心跳。

因此，怀孕6周之前是查不到孕囊的。但是如果在怀孕6周以后去检查，还是查不到孕囊的话就需要重视起来，因为有可能是孕囊发育缓慢，未达到正常周期大小，或者是流产、宫外孕也都有可能。