做二代试管的医生在试管过程中是不知道胚胎性别的，因为二代试管只能确定胚胎质量，并且是禁止性别鉴定的。目前一般的医院大部分都是做的一代和二代试管婴儿，并且一代、二代都是不能挑选男女的，只有三代的才可以做挑选男女，但是要注意必须提供相关证明，证明有家族遗传，并且还是那种只传男性或者只传女性的，才可以挑选。

二代的试管技术就是将在男性取出的单个精子在显微镜下注射进入女性取出并且成熟的卵子当中，已达到助孕目的，二代试管婴儿对帮助患有男性不育症起到重要作用，但是由于相关的规定和医生的职业操守，在二代试管过程中是不清楚胚胎性别的：

1. 1. 禁止性别鉴定。试管婴儿是辅助生殖技术,并且根据相关规定是禁止选择性别的，禁止非法进行胎儿性别鉴定就是为了防止那些只想要男孩或者只想要女孩的家长，一旦知道了性别，可能会提前终止妊娠；
2. 2. 只能确定胚胎质量。做二代试管需要通过梯度离心或是离心的方式进行筛选精子，应选择优选的精子，把患者精子放到培养皿中和卵子结合，或是直接打到卵子里面。虽然可以挑选优质的精子，但不能用来判断是x精子还是y精子；
3. 3. 医生的职业操守。在有明确禁止非医学性的胎儿性别鉴定的情况下，很多医生即使在做试管的过程中已经知道了胚胎的性别也会基于自己的职业操守不会告诉准爸妈们的。
   

由此可见，做二代试管是不能知道胎儿性别的，因为从技术上来看第二代试管婴儿技术是不能首先性别选择的，因为选择性别是需要对胚胎进行染色体检查的，但是在试管婴儿的技术操作中部包括这项技术，所以做二代试管婴儿的朋友是不能选择性别的。试管婴儿适用于不能自然受孕的夫妻，不能选择胎儿性别，这也是法律规定的。

试管移植就是指从女性子宫卵巢内取下卵细胞，在离体精子形成授精并塑造3到5日，再将生长发育到囊胚期环节的试管移植到子宫内，使其受精卵着床发育成胎宝宝的全过程。并且在二代试管移植的时候，医生是不知道胎儿性别的。在我国想要知道胎儿性别的话，只有通过B超检查、绒毛采检术等方法才能知道：

1. 1. 绒毛采检术。通常在怀孕8-10周时做。主要目的为了诊断胎儿是否有染色体方面或神经管的缺陷，但也有人用来诊断胎儿的性别，准确率可达98%；
2. 2. B超检查。怀孕期间测定胎儿性别的方式有很多，B超预测胎儿性别就是最常用的一种，一般在16周以上才能比较清楚的辨别胎儿的性别，因为这个检测方法主要是看胎儿的生殖器官，所以与胎位和医生的经验有着直接的关系，男的准确率可以达到90%，而女的只有85%。

总之，在目前的几种试管婴儿技术中第一代和第二代试管婴儿技术都是不能进行性别选择的，只有第三代试管婴儿技术才能通过移植前遗传学诊断和染色体筛查技术对胎儿的性别进行选择，同时也排除胚胎携带基因缺陷和染色体变异的胚胎，更有效的保障了下一代的健康问题。