第一代试管和第二代试管儿的费用主要是差在治疗的难度。一代试管儿主要是以女性为主对男子质量也有一定的要求。二代试管主要是针对男性的不育所以说技术要比一代的主要是治疗男子的无精症。因为这种精子数量少质量差，不能完成自主的受精，所以需要在显微镜下操作直接打到卵泡儿来完成受精达到怀孕的目的。

以目前试管婴儿的收费标准来看，并没有具体区分一代和二代，因为试管婴儿收费不仅仅是由手术费决定，其中还包含检查以及药物治疗费。由于用药和个体差异，目前平均一个试管周期的费用大致在3-4万，而一代是采取体外自然受精方式，人工辅助操作少，二代则是单精子注射，对技术要求更严格，所有二代试管费用比一代费用高出几千元。