两者从本质上是没有什么不同的。社保卡中的资金也是居民自己进行缴纳的，与自费没有区别，大多数医院会将建卡是进行的检查认为能够使用社保和需要自费两种类型，只是两者手续可能会存在一些差异，不同的医院规定会有所差异，需要具体到医院进行咨询。

建卡时用社保和自费的项目

1. 1. 要求孕妇空腹到医院先进行基本数据的测量，例如身高、腹围、体重、宫高等；
2. 2. 之后还会进行白带常规检查、尿液常规、腹部超声以及血液常规等检查项目；
3. 3. 还会对女性进行淋病、艾滋病检查、巨细胞病毒、风疹病毒检查；
4. 4. 乙肝功能、肝肾功能等，还可以要求进行染色体或者唐氏等方面的检查。

本身社保卡中的费用就是参加社保时进行缴纳的，使用社保卡缴费和自费是一样的，只是从缴费流程上会有一些差异，如果是使用医保卡缴费差别会更大一些，毕竟详写项目在医保报销范围内。