清宫手术后吃芬吗通是会影响月经。芬吗通中含有大量的雌激素和孕激素，帮助女性调整月经周期。一般情况下，在连续吃21天的芬吗通停药3至5天之后就会来月经。通常需要在月经第五天开始服用，每天服用一次，连续服用21天，停药几天之后来月经，从而建立人工月经周期。如果停药5天还没有来月经就需要去医院进一步检查。