在白带清洁度3度和衣原体阳性期间是不能做试管婴儿手术的。白带清洁度3度说明阴道存在炎症，而产前衣原体阳性说明子宫内膜、输卵管存在炎症，此时做试管怀孕会引起宫腔感染，导致胎儿胎膜发生感染、早破，发生早产或流产。

由于支原体阳性会导致泌尿系统、生殖系统炎症，此时做试管婴儿会把炎症带到盆腔或者宫腔，使胚胎在移植过程中很容易被病毒感染，进而出现胚胎死亡、自然流产、体重低、畸形等，无论是对母体还是胚胎的风险都是非常的大，所以不能做试管，具体原因如下：

1. 1. 出现胎儿畸形。如果衣原体呈阳性，极其有可能把病毒遗传给胎儿，导致胎儿出现畸形或者出现低能的情况，衣原体呈阳性应该先到医院进行正规的治疗；
2. 2. 出现早产、流产。衣原体阳性是不能够做试管婴儿的，衣原体呈阳性的患者，都有尿路感染的情况，在做试管婴儿的过程中有可能导致胎儿出现流产和早产的现象；
3. 3. 胎儿被感染。产前衣原体感染可引起羊膜炎，产后子宫内膜炎，流产后输卵管炎。感染衣原体的孕妇，阴道分娩的新生儿期被感染的风险非常高，结膜炎的发生者为25%~50%，衣原体肺炎为10%~20%。

所以说，为了宝宝的健康，当支原体阳性的时候是不能做试管婴儿手术的，一定是要治疗好后才可以进行试管婴儿助孕。当然像这样的情况，也可以先进行取卵、取精，培养胚胎，然后将胚胎冷冻，等治好支原体感染后再进行试管婴儿的胚胎移植，以免耽误取卵的最佳时间。

支原体阳性会引起生殖器的炎症，危害胚胎的健康发育，从而影响试管移植的成功，所以需要治愈后才能选择做试管。通常支原体阳性可以采用口服给药的治疗方法，也可以采用静脉注射阿奇霉等抗生素进行治疗，具体的治疗方法如下：

1. 1. 口服药物。支原体阳性，考虑支原体感染，可给以多西环素，强力霉素莫西沙星或左氧氟沙星对抗支原体治疗，般需治疗2个疗程以上，直到临床症状消失，支原体抗体阴转才可以进行试管；
2. 2. 注射针剂。可以注射红霉素、罗红霉素、克拉霉素、阿奇霉素等大环内酯类抗生素，这类抗生素针对支原体、衣原体有效，并且涵盖较广泛。

需要注意的事，由于支原体感染是性传播疾病的一种，所以在治疗的时候最好是夫妻一起治疗，这样才会取得更好的治疗效果和作用，而且治疗期间不可以出现性交，以免传染给性伴侣，并且避免和患者公用一些东西，还需要做一些预防传染给家里人的措施。