四联疫苗和免费疫苗主要区别就在费用方面、强制性、适应症方面。四联疫苗一般是需要自费并且根据自身意愿选择接种的,而免费疫苗是国家强制性接种的,无需自费。目前四联疫苗主要是用于预防百日咳、破伤风、白喉以及b型流感嗜血杆菌引起的一系列疾病等,而目前国家的免费疫苗主要包括麻风疫苗、百白破疫苗、乙肝疫苗、甲肝减毒活疫苗等,针对的适应症有一定区别。
四联疫苗与免费疫苗有不同的效果。四联疫苗包括白喉、百日咳、破伤风和由乙型流感嗜血杆菌引起的流感疫苗。免费疫苗仅包括三联疫苗,通常为白喉、百日咳和破伤风。与四联疫苗不同,没有由乙型流感嗜血杆菌引起的流感疫苗,因此对流感没有一定的免疫效果,对预防流感也没有一定的效果。