免费的乙脑疫苗和自费的乙脑疫苗在预防的效果上并没有什么区别，也没有说哪种就会比较好，主要是看个人的选择；乙脑疫苗主要是为了预防流行性乙型脑炎，是预防该疾病的有效方式，接种乙脑疫苗无论是自费的还是免费的都需要接种两针，第一针是在满8月的时候打，第二针是在2岁的时候。

乙脑疫苗免费的和自费的区别

1. 1. 疫苗类型：免费的乙脑疫苗叫做乙脑减毒活疫苗，属于一类疫苗，同时是活疫苗，自费接种的乙脑疫苗属于二类疫苗，类型是灭活疫苗；
   
2. 2. 产地：免费的乙脑减毒活疫苗是国产的，自费的乙脑灭活疫苗是进口的；
   
3. 3. 安全性：自费的乙脑灭活疫苗比免费的乙脑减毒活疫苗安全性更高一些，因为灭活疫苗是将细菌或病毒经过处理以后，没有活性了制成的生物制剂，而减毒疫苗是降低了细菌和病毒的活性，保留了部分活性。
   

总的来说，这两种疫苗的预防效力都是差不多的，在接种的时候按个人所需接种就行，但就性价比而言免费的乙脑疫苗比较好一些。