亲子鉴定百分之88不一定是亲生的。亲子鉴定中一般三个以内点位亲权指数低于99.95%可能是基因突变导致的，而且DNA检测本身也存在出现误差的可能，此时是否具有亲子关系需要通过二次复检确认，一般没有亲子关系点位数值应该是趋于0，所以88%有可能是亲生，但也有可能是只具有血缘关系，即孩子是侄子。

亲子鉴定就是通过DNA的遗传规律来确认亲缘关系的一种方法，目前运用的场景比较多，比如给孩子上户口、抚养权确认以及对孩子归属存疑时都是可以通过鉴定来确定的，一般鉴定结果全都在99.95%以上才说明标本双方具有亲子关系，如果检查出只有88%可能是以下原因导致的。

1. 1. 基因突变：在亲子鉴定中如果具有亲子关系，那么21个点位的亲权指数应该都在99.95%以上，如果有三个点位在这个数值以下则判定不是亲生，如果有一个百分子88可能是基因突变造成的；
2. 2. 检查出错：虽然DNA检测的准确率非常高，但是也不能保证结果百分之百的正确，不论是检测过程还有标本的对应方面都是有可能出错的，百分之88也可能是检查错了；
3. 3. 血缘关系：一般情况下如果没有亲子关系那么点位的亲权指数应该是趋于0的，如果在鉴定中数值为88%，那么有可能是亲生，也有可能是只具有血缘关系，孩子和家里其他亲人具有亲子关系。

如果是基因突变或者检查结果出错导致的，一般经过第二次针对性地复检即可证明亲子关系，但是如果经过复检点位还是88%，那么可能孩子不是自己亲生，不过在鉴定时也要注意两次所提取的标本需要来自同一个人，如果标本出错检查出来的结果也是不一样的。