区别在于免费的疫苗是国家一类疫苗，是通过口服接种的方式；自费的疫苗是采取注射的方法，是进口的疫苗，且每次注射200元，但是自费的疫苗有它的优点，不容易引起呕吐这些副作用。另外，注射自费疫苗以后要观察半小时，如果孩子没有不适再离开医院。

小儿麻风疫苗自费的和免费的在免疫效果上是一样的。小儿麻风疫苗是指麻疹和风疹两种疾病的疫苗，主要用于预防麻疹和风疹。一般情况下，您需要携带自己的疫苗制剂接种本到当地卫生机构或市疾病预防控制中心接种，这种疫苗属于国家免疫规划，所以是免费的，叫做一类疫苗，自费疫苗也叫二类疫苗，二类疫苗也叫计划外疫苗，不强制接种的疫苗。

麻风疫苗的作用

1. 1. 为预防麻疹病毒引起的高度传染性疾病，主要预防临床表现为三联症、咳嗽、鼻炎、结膜炎、皮肤上的红色黄斑丘疹和口腔粘膜上的麻疹粘膜斑引起的疾病；
2. 2. 预防麻风杆菌，这是一种非常强大的细菌，感染后会有发热、呼吸道症状，严重时甚至引起病情恶化，麻风疫苗避免病毒入侵；
3. 3. 预防由腮腺炎病毒引起的全身性病毒感染，起到预防急性传染病，以低热、全身皮疹和淋巴结病为特征的疾病。

综上所述，麻风疫苗可以预防麻疹和风疹，国家疫苗免疫程序规定8月龄婴儿接种1剂麻风疫苗；18～24月龄接种1剂次麻腮风疫苗，而国家免疫程序内的疫苗都应该是免费的并且要及时提供给儿童。

免费的属于国家强制性打算免疫，要求宝宝必需在规按时间接种完成的打算疫苗，非论体质强弱，都需要接种；而自费的属于二类疫苗，是按照宝宝自身体质需要自愿接种的疫苗，不做强行要求。所以两种疫苗的的性质是不同的，没有哪个接种效果更好一说。一类疫苗最好在划定预约时间按时接种，不能提前，可是由于疾病等原因不能接种的，可以推迟补种，并全面填写预防接种卡，入学时检查；二类疫苗属于自愿，可是对于有的免疫缺陷宝宝也是需要预约接种的，不是说免费的一类疫苗比自费的二类疫苗更重要。