三甲医院做一次胚胎染色体检查大概需要花费2000元左右，胚胎染色体检查费用并不固定，受到医院等级、地区、当地政策的影响，如果是前往三甲医院进行胚胎染色体检查，就可能需要2000元左右。胚胎染色体检查属于一种无创筛查，一般都在怀孕15-18周进行，需要孕妇空腹抽血化验，能够帮助孕妇排查胎儿染色体存在畸形的可能性，如果结果为高风险，就需要进行羊水穿刺等检查。

影响胚胎染色体检查费用的因素

1. 1. 医院等级：一般来说，医院等级越高，所用设备和医生就会好，所涉及的胚胎染色体检查费用就会相应增加；
2. 2. 地区：一个地区的消费水平对胚胎染色体检查费用起着一定的影响，如果地区的消费水平高，检查费用就会比较高；
3. 3. 当地政策：部分地区颁布了相关政策，可以对孕期的一些检查费用予以报销，如果当地颁布过这项优惠政策，胚胎染色体检查费用就会比较低；
4. 4. 患病程度：如果是针对胚胎的染色体进行微缺失或微重复的检测，这个花费就会比较高一般需要基因芯片，花费3000到5000元左右。

总的来说，胚胎染色体检查费用主要受以上这些因素的影响，且波动是比较大的，孕妇可以在怀孕15-18周进行该项检查，以便筛查胎儿是否存在这类疾病，帮助孕妇生下健康的孩子。