克氏综合征做三代试管的成功率能不能有50%需要看情况。克氏综合征遗传的概率大概在29.4%到46%，所以是不能自然怀孕的，不过可以借助三代试管筛选染色体异常的精子，帮助减少遗传的概率，这样是有机会怀孕的，但是并不能保证一定成功，三代成功率50%的前提是男性有可用精子，女性子宫条件好。

克氏综合症的全名叫做克莱恩费尔特氏综合征，是一种男性先天性的染色体异常疾病，这个疾病的表现为男性睾丸发育不全、精液中无精子、阴茎短小等，这些症状在婚后会直接导致女性不孕不育或者疾病遗传，所以最好是做第三代试管怀孕，但是做三代的成功率能不能达到50%还是要看以下两种情况。

1. 1. 有无精子：克氏综合征最主要的症状就是精液中无精或少精，所以需要在显微镜下切开睾丸取精，如果能取到可用精子，试管成功率就有50%，如果不能取到精子，即使做三代试管，也不能成功；
2. 2. 女方情况：试管时不仅需要男方精子质量数量达标，女性的子宫卵巢条件也非常重要，因为克氏综合征的男性精子质量并不会太高，如果女性身体条件好，试管可能会成功，但是如果本身卵巢功能低下或者子宫内膜薄，受精卵也不容易存活。

目前针对克氏综合症主要的助孕方式就是三代试管，但是并不一定成功，在试管过程中可能需要多次取精移植，如果移植成功也需要在孕16周左右做羊水穿刺再次进行染色体异常筛查，所以过程是非常艰辛的，如果三代试管不成功我们也可以考虑精子库助孕或者领养等方式。