最好是先治疗,因为有巧克力囊肿的话怀孕的几率是比较低的,其次就是怀孕后可能会影响宝宝的发育,在怀孕期间胎儿也在长大,如果囊肿没有治疗,也增大的话就极有可能压迫到宝宝,最后说不定就流产了。所以我认为你应该治疗了再怀孕,给宝宝提供一个较好的环境,保证宝宝能顺利的生长