医生一般是不会建议宝宝不打自费疫苗的。无论是免费疫苗还是自费疫苗，都能够对一些传染性危害性极大的疾病起到一定的预防作用。但是由于自费疫苗属于二类疫苗，所以是需要自己花钱的，价格一般比较昂贵，所以如果家里经济条件允许的情况下，也是可以进行接种的，全凭个人自愿。

不建议接种自费疫苗的原因

1. 1. 发病率低：自费疫苗针对一些疾病是有一定的预防作用的，但是和免费疫苗所针对的疾病相比，发病率相对较低，所以一般不建议接种，家庭情况允许的情况下，也是可以接种的；
2. 2. 影响性：免费的一类疫苗已经在人群中大规模使用了，并且已经能够将其所针对的传染病发病率控制到最低的水平了，然而自费疫苗所针对传染病对宝宝的影响并不是很大，所以没有接种的必要。

总而言之，孩子由于年纪尚小，免疫系统还没有发育完善，所以很难抵挡病毒的侵害。因此需要借助疫苗来预防疾病，至于是否接种自费疫苗，家长可以根据宝宝的身体情况以及家庭的经济状况来决定。