功能性滤泡囊肿应该先进行治疗后再考虑促排或者人授。一般情况下，在有囊肿的情况下，都应该先对囊肿进行检查，判断囊肿是病理性还是生理性，如果是病理性的，可能会影响胎儿的发育，严重的还会导致先兆性流产的情况，特别是滤泡囊肿，它导致不孕不育的几率特别大，所以要先进行治疗。

随着社会的发展，人们的生活压力不断加大，不孕不育的人群逐年上涨，不过好在科技的发展，试管移植和人工授精可以很好的解决这一问题，如果选择人工授精的话，在患有囊肿的情况下是要先进行治疗的，不然是无法进行促排和手术的，原因可以从以下几个点来看：

1. 1. 影响卵泡生长：滤泡囊肿是一种常见的生理性囊肿，囊肿比较大的时候会影响卵泡的生长，排卵也会相应的受影响，小的囊肿可以随访观察，大的囊肿，查过肿瘤标志物以后就要尽快手术；
2. 2. 破坏卵巢功能：这种情况会影响妇女的怀孕。妇女的卵巢健康非常重要。如果出现滤泡囊肿，且长期不能有效治疗，则其生长缓慢。最后，它们会压迫卵巢，影响卵巢的正常功能，出现内分泌功能障碍，导致卵子质量差和毛囊发育不良；
3. 3. 引起并发症：滤泡囊肿是一种很常见的妇科疾病，如果不能及时治疗的话，还会引发其他病症，有些时候由于滤泡囊肿和黄体囊肿过速的生长导致卵巢的组织受到拉扯而裂开流血。

所以，在出现了功能性滤泡囊肿后，不能进行人工授精也不能进行促排，需要先进行治疗后才能够考虑，如果不及时进行治疗，强行进行促排或者人工授精的话，怀孕后囊肿很有可能会由于激素的变化而发生改变，这样会造成严重的后果，所以要尽早到医院就诊。

根据研究表明，人工授精需要优质的精子和卵子进行结合，才能提高成功率，所以当身体达到要求时，一般是先进行促排，当功能性滤泡治愈后，如果想要备孕，一般是要先进行促排治疗，当能够获得足够优质的卵子后，再考虑进行试管，这样做的好处有以下几点：

1. 1. 促进卵泡发育：帮助卵泡发育、成熟，促进其分泌雌激素。促排针里面含有黄体生成素以及卵泡刺激素，起主要作用的是卵泡刺激素；
2. 2. 为人授做准备：人工授精一般是需要促排的，因为促排可以促进卵泡发育成熟，这样也是可以增加受孕几率的注射促排卵针也可以保证人工授精成功率，而且这种激素对人体也没有什么副作用。

总的来说，在有功能性滤泡囊肿的情况下，不能进行促排也不能做人工授精，需要先对囊肿进行治疗，以免为以后的怀孕埋下隐患，在治愈后，优先考虑进行促排，这样能够获得足够多的优质卵子，也为以后的人工授精创造了更多可能性，如果在治疗过程中有任何不适，一定要及时就医。