建议女性最好是先进行巧囊手术后再去取卵移植。一般如果在患有巧克力囊肿的情况下是不建议先取卵的，如果女性先取卵再进行巧克力囊肿手术，很可能会导致女性身体受到一定的影响，比如可能会造成卵泡数量和质量不佳、血小板减少引起子宫肌瘤或出血现象、影响试管移植成功率等。

巧克力囊肿又叫盆腔子宫内膜异位症，是子宫内膜异位症最主要的表现形式。巧克力囊肿一般会影响女性的受孕几率，而且怀孕后很容易流产，所以在试管前发现自身患有巧克力囊肿，一定要先及时治疗，避免对移植成功率造成影响。如果女性先取卵再进行巧囊手术，可能会对女性造成以下影响：

1. 1. 引起腹痛或炎症：如果有巧囊的患者在试管移植前，先取卵再进行巧囊手术的话，在取卵手术过程中，很可能会导致巧囊破裂。巧囊破裂后里面的囊液流出到盆腹腔有可能会引起腹痛或其他的炎症，严重的话还会影响以后怀孕；
2. 2. 导致子宫出血：因为巧克力囊肿是一种恶性的肿瘤，在自身患有巧囊的情况下进行取卵，可能会导致血小板减少，严重的情况下可能会导致子宫肌瘤，子宫出血等症状，建议女性最好先到正规的医院进行手术切除巧克力囊肿后，再进行取卵和试管移植；
3. 3. 试管移植成功率低：患有巧克力囊肿的女性，如果直接开展试管周期，先进行取卵手术，然后再进行巧囊手术，那么很可能会影响取卵的数量和质量，还有之后进行胚胎移植的成功率，甚至可能会导致试管以失败告终。

因此，建议女性在进行试管移植周期之前，先在医生建议下，选择适合自己的方案进行巧克力囊肿的治疗后，再进行取卵和移植手术。在巧克力囊肿治疗后，还需要随时观察，定期前往医院进行检查，才能预防其复发。还需要注意的是，在进行巧克力囊肿手术后一定要间隔三个月，才可以进行试管移植。

巧克力囊肿并不难治疗，通常根据囊肿大小来判断使用药物保守治疗或是手术治疗，如果选择手术治疗，一般选择使用腹腔镜微创手术进行治疗，治疗效果更好。在进行巧克力囊肿手术后还需要注意以下事项，才能帮助自己尽快恢复健康，顺利的进行之后的取卵移植手术：

1. 1. 个人卫生：巧克力囊肿患者手术后，要注意个人卫生，注意伤口部位的消毒，术后还要合理地调整饮食结构；
2. 2. 术后保暖：手术后患者要注意身体保暖，避免身体着凉，身体着凉后机体免疫功能会下降，会影响到伤口的愈合。

在巧克力囊肿手术后，如果想要进行取卵移植手术，建议先前往医院进行一下全面的身体检查，确保没有影响移植的因素之后，再进行取卵和移植手术成功率会更高。同时还可以通过服用孕激素药物，比如地屈孕酮、甲地孕酮、黄体酮等，来预防巧克力囊肿的复发。