宝宝肠道功能差可以吃益生元。益生菌是人体中的一种有益细菌，主要功能是调节肠道菌群，而益生元是帮助益生菌改善肠道菌，在肠道被有益菌发酵，产生有机酸，并且促进有益菌类的生长。直接补充益生菌并不能达到改善肠道的效果，而补充益生元就可以为肠道内益生菌提供足够的能量，并且促使益生菌大量繁殖，因此，宝宝肠道功能差可以补充益生元。

益生元和益生菌的区别

1. 1. 本质区别：益生菌是外部添加入体内的细菌，益生元是作用与原本存在于体内的菌群；
2. 2. 成分不同：益生菌是有生物活性的细菌，益生元主要是无生物活性的糖类物质；
3. 3. 作用方式不同：益生元是促进肠道有益菌的生长从而发挥间接作用，益生菌是直接作用，可以直接调理肠道的菌群；
4. 4. 受胃酸环境的影响不同：益生菌在胃部强酸性的环境下，其活性会在一定程度上受到胃酸的破坏，而益生元只是一种糖类，不存在存活率的问题。

综上所述，益生元和益生菌的区别还是比较大的，大家可以根据自己的需要进行选择，如果自己无法区别，可以在医生的指导下进行选择，千万不能盲目用药。